Не знаю, как-то не попадалась такая универсальная программа, да чтобы качественно, да чтобы бесплатно, да чтобы ... (нужное вписать). Слишком уж общий запрос. Я для этих целей пользуюсь несколькими программами - каждая хороша по своему. Если нужно конвертировать mp3, ra, vqf, wma в wav, то на первый раз сойдет и Winamp с соответствующим плугином. Если wav в другие форматы, то могу посоветовать следующий бесплатный софт:
В mp3 - Lame Encoder
http://www.sulaco.org/mp3/
в wma - Winamp
http://www.winamp.com
в ra - на сайте http:/real.com должен быть бесплатный энкодер.