Чтобы выключить сообщения, которые иногда вылазят в notification area, вот что можно сделать.
В реестре по адресу HKEY_CURRENT_USER/Software/Microsoft/Windows/Current Version/Explorer/Advanced создать ключ типа DWORD под названием EnableBalloonTips, и присвоить ему значение 0. Присвоив ему значение 1, можно вновь разрешить показывать сообшения.